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PHF12 - PHD finger protein 12 Gene

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中文名称：PHD 指蛋白 12

种属: Homo sapiens

同用名: PF1

基因 ID: 57649 | 基因类型: protein coding

关于 PHF12

Cytogenetic location: 17q11.2 Genomic coordinates (GRCh38): 17:28,905,250-28,951,518 (from NCBI)

This gene has 17 transcripts (splice variants), 252 orthologues and 5 paralogues. Ubiquitous expression in bone marrow (RPKM 8.9), spleen (RPKM 8.2) and 25 other tissues.

功能概要

启用磷脂酰肌醇结合活性和转录辅助抑制活性。参与转录的负调控，以 DNA 为模板。在 RNA 聚合酶 II 的转录负调节上游或负调节内起作用。位于核质中。 Sin3 复合体和转录抑制复合体的一部分。 [由基因组资源联盟提供，2022 年 4 月]

Enables phosphatidylinositol binding activity and transcription corepressor activity. Involved in negative regulation of transcription, DNA-templated. Acts upstream of or within negative regulation of transcription by RNA polymerase II. Located in nucleoplasm. Part of Sin3 complex and transcription repressor complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

PHF12 基因产物(3)

mRNA Protein Name
NM_001033561.2 NP_001028733.1 PHD finger protein 12 isoform 1
NM_001290131.2 NP_001277060.1 PHD finger protein 12 isoform 3
NM_020889.3 NP_065940.1 PHD finger protein 12 isoform 2
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables phosphatidylinositol binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
16893883 GOA
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
11390640 GOA
enables transcription corepressor activity IDA
IDA: 通过直接分析推断
22048773 GOA
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in negative regulation of DNA-templated transcription IDA
IDA: 通过直接分析推断
11390640 GOA
acts upstream of or within negative regulation of transcription by RNA polymerase II IDA
IDA: 通过直接分析推断
22048773 GOA
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of Sin3-type complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
22048773 GOA
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
11390640 GOA
part of transcription repressor complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
11390640 GOA
EXP：通过实验结果推断 IDA：通过直接分析推断 IPI：通过物理相互作用推断 IMP：通过突变表型推断 IGI：通过遗传相互作用推断 IEP：通过表达模式推断

PHF12 蛋白结构

PHD

PHD: PHD-finger (59 - 104)

PHD

PHD: PHD-finger (273 - 316)

  • 0
  • 200
  • 400
  • 600
  • 800
  • 1004 a.a.
蛋白主名 其他名称

PHD finger protein 12

PHD factor 1

PHF12 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
PHF12 Q96QT6 MORF4L1 Homo sapiens Q9UBU8-2
Anti Tag CoIP
26496610
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

关联疾病

疾病名称 别名
Peroneal Nerve Paralysis

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HY-RS29236 Phf12 Rat Pre-designed siRNA Set A Pre-designed Set / 否

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Canis familiaris PHF12 VGNC VGNC:44482
Macaca mulatta PHF12 VGNC VGNC:75838
Felis catus PHF12 VGNC VGNC:64138
Rattus norvegicus PHF12 RGD RGD:1305731
Mus musculus PHF12 MGD MGI:1924057
Bos taurus PHF12 VGNC VGNC:32814
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