1. Gene
  2. Cdk9 - cyclin-dependent kinase 9 (CDC2-related kinase) Gene

Cdk9 - cyclin-dependent kinase 9 (CDC2-related kinase) Gene

中文名称:细胞周期蛋白依赖性激酶 9 (CDC2 相关激酶)

种属: Mus musculus

同用名: PITALRE

基因 ID: 107951 | 基因类型: protein coding

关于 Cdk9

Chromosome 2: 32,595,796-32,603,088 reverse strand.GRCm39:CM000995.3

This gene has 9 transcripts (splice variants), 208 orthologues, 25 paralogues and is associated with 15 phenotypes. Ubiquitous expression in ovary adult (RPKM 28.4), thymus adult (RPKM 26.4) and 28 other tissues.

功能概要

该基因编码的蛋白可启动多种功能,包括 RNA 聚合酶 II CTD 七肽重复激酶活性;染色质结合活性;和核酸结合活性。参与组蛋白 H2B 泛素化的正调控和组蛋白磷酸化的正调控。位于核内。细胞周期蛋白/CDK 阳性转录延伸因子复合物的一部分。以多种结构表达,包括消化系统;早期胚胎;泌尿生殖系统;淋巴系统;和神经系统。与人 CDK9(细胞周期蛋白依赖性激酶 9)同源。 [由基因组资源联盟提供,2022 年 4 月]

Enables several functions, including RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity; chromatin binding activity; and nucleic acid binding activity. Involved in positive regulation of histone H2B ubiquitination and positive regulation of histone phosphorylation. Located in nucleus. Part of cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex. Is expressed in several structures, including alimentary system; early embryo; genitourinary system; hemolymphoid system; and nervous system. Orthologous to human CDK9 (cyclin dependent kinase 9). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Cdk9 基因产物(1)

mRNA Protein Name
NM_130860.3 NP_570930.1 cyclin-dependent kinase 9
基因本体论
  • 分子功能
  • 生物过程
  • 细胞组分
分子功能 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
enables RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity IMP
IMP: 通过突变表型推断
22509028 MGI
enables RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
21245044 MGI
enables chromatin binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
16245309 MGI
enables protein binding IPI
IPI: 通过物理相互作用推断
12037670 MGI
enables protein kinase binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
22547058 MGI
enables snRNA binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
16109376 MGI
enables transcription cis-regulatory region binding IDA
IDA: 通过直接分析推断
20570862 MGI
生物过程 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
involved in regulation of mRNA 3'-end processing IMP
IMP: 通过突变表型推断
19575011 MGI
细胞组分 GO 注释 逻辑证据 参考文献 来源
part of cyclin/CDK positive transcription elongation factor complex IDA
IDA: 通过直接分析推断
23752591 MGI
located in nucleus IDA
IDA: 通过直接分析推断
16109376 MGI
EXP:通过实验结果推断 IDA:通过直接分析推断 IPI:通过物理相互作用推断 IMP:通过突变表型推断 IGI:通过遗传相互作用推断 IEP:通过表达模式推断

Cdk9 蛋白结构

STKc_CDK9

STKc_CDK9: cd07865 (5 - 314)

  • 0
  • 100
  • 200
  • 300
  • 372 a.a.
蛋白主名 其他名称

cyclin-dependent kinase 9

cell division protein kinase 9

Cdk9 蛋白互作信息

分类
蛋白名称 蛋白编号 互作蛋白 互作蛋白种属 互作蛋白编号 实验方法 参考文献
种属内
Cdk9 Q99J95 Max Mus musculus P28574 20434984
种属内
Cdk9 Q99J95 Srsf2 Mus musculus Q62093 23663783
种属内
Cdk9 Q99J95 Brdt Mus musculus Q91Y44 20593818
种属内
Cdk9 Q99J95 Brdt Mus musculus Q91Y44 22922464
种属间: 跨种属相互作用 种属内: 同种属相互作用

直系同源

种属 基因名 来源 基因 ID
Homo sapiens Cdk9 NCBI NCBI:1025